为什么植入的胚胎不能着床成功，一直是治疗不孕症的医生、生殖医学科学家及不孕相关从业人员极想知道及探讨的问题。经过不孕症医生及生殖科学家的研究，胚胎着床失败的原因可归纳下列几种：
一、子宫内膜接纳胚胎的能力下降
(1)子宫构造异常：
如：子宫先天性发育畸形(双角子宫、子宫纵膈)、子宫内膜息肉、子宫内膜炎和子宫腔内肌瘤。
子宫肌瘤如果长在子宫肌层，离子宫腔一公分以上，并且肌瘤大小不超过5公分则不会影响试管婴儿助孕的怀孕率。
(2)子宫内膜薄：
曾经因为流产做过子宫搔刮术、月经不正常(持续月经来潮)或者血液循环不好，都会造成子宫内膜薄。
(3)子宫腔持续积水：
输卵管水肿及不通会造成子宫腔积水，这是因为输卵管的积水因输卵管伞部(尾端)阻塞，造成输卵管内的积水往子宫腔流之故。持续性的子宫腔积水会造成胚胎着床失败。但多囊性卵巢症患者在他们接受排卵药物刺激之后，偶尔也会引起子宫腔积水，但不造成着床不易(失败)的问题。
(4)子宫内膜分泌的黏性蛋白的品质不好或是量不足或是子宫腔内某种细胞素的量太少或者太多，都会影响胚胎的着床成功与否。
像一种蛋白称为αVβ3，在胚胎着床(排卵后六天)前后，子宫内膜细胞会制造并释放。如果在胚胎着床期，这种蛋白制造或者释放少，会引起胚胎着床失败。
(5)有自体免疫疾病或有偶血栓形成体质和习惯性流产有关是不争的事实，但和胚胎重复着床失败是否有关联，目前还没定论。
二、植入子宫的胚胎自身有缺陷
(1)夫妻染色体有异常会影响胚胎的发育，使胚胎长到某一阶段即会停止生长。
妻子患有染色体异常，像染色体平衡对调、嵌合型染色体、染色体反向转位、染色体缺失、染色体断裂(尤其是断裂在染色体中央节部位时，即使年轻女性做试管婴儿重复失败的几率也比较高)。
有些精子稀少、活动力不好(少精、弱精)的患者，将他们的精子做荧光抗体杂交检查精子染色体数目是否正常，发现他们的精子染色体数目异常的比例比精子数量正常及活力正常者更高。这类夫妻做试管婴儿(因为精子质量不好，须再配合做单一精虫卵细胞质注射)通常有较高的失败率(因为精子染色体异常率比较高的原因)。
(2)包围卵子的透明带，在卵子受精前和胚胎孵化着床前是用来保护卵子和胚胎。如果胚胎在体外培养过久，透明带会变厚及变硬;年纪大的妇女所排出的卵子及透明带也比较厚。透明带太厚或者太硬有可能会引起胚胎着床失败。
(3)体外培养环境不好，包括培养液不良、温度不当或操作技术欠佳，都有可能损害胚胎，引起胚胎着床失败。
三、其他引起植入胚胎着床失败的原因
子宫内膜异位症尤其是重度子宫内膜异位症会引起卵巢对排卵药物的反应变差，胚胎质量、着床和怀孕率也都会下降。但也有研究指出，虽然子宫内膜异位症患者对排卵药物反应较差，但胚胎质量及怀孕率不会下降。
输卵管水肿会影响植入胚胎着床不易这是不争的事实。它的影响是因为输卵管水肿内的液体偏碱性，含有对胚胎着床有害的细胞素、前列腺素及其他炎性物质，并且因输卵管水肿的异体会倒流入子宫腔也会造成胚胎不能与子宫内膜接合。
对于一次或多次移植失败的家庭，千万不要灰心丧气，尽可能找出自己着床失败的原因，并在下次移植前接受治疗，增加再次移植成功率。此外准爸妈一定要保证良好的心态，不要太有负面情绪，相信小宝宝一定会健康到来的。
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