1、内分泌异常
男性正常生精功能依赖于下丘脑—垂体—性腺轴功能的正常，其中任何一环节障碍，都会影响生精功能，其它如甲状腺、肾上腺疾病也会影响生殖腺功能而致少精子症。
2、隐睾
有研究报道，单侧隐睾患者约有30%～60%不育，双侧隐睾则有50%～100%发生不育，少精症中隐睾患者约占9%。隐睾本身除了曲细精管退化影响生精之外，另一侧下降完全的睾丸也可能有不同程度的损害，原因可能是由于隐睾产生的抗精子抗体对正常睾丸的影响。
3、泌尿生殖系统炎症
包括睾丸炎、附睾炎、精囊炎、前列腺炎、尿道炎等，这类患者在少精症中比例最多。泌尿生殖道的炎症可以直接影响睾丸生精功能，还可以使血液或者精液中产生抗精子抗体，影响精液的酸碱度，加上病原体对精子的直接杀伤作用，可造成精子减少。
4、精索静脉曲张
精索静脉曲张导致的不育症占男性不育的30%～40%。由于睾丸温度升高及毒素淤积等原因使睾丸生精功能受到影响，引起少精症，严重的可造成无精症。精索静脉曲张初起症状不明显，病情重者可感觉阴囊部坠胀，上面突起如蚯蚓状血管团。精液检查可见，精子数量下降，活动度差，畸形精子数增多。
5、阴囊温度过高
睾丸中专门用来制造精子的曲精管对温度变化非常敏感，这个部位适宜温度比人体体温要低2～3℃，温度过高容易抑制精子的生存和成熟，造成精液中精子数量减少或活动能力降低。因此，男性朋友应少穿紧身裤，少洗桑拿浴，避免电磁辐射和高温，养成良好的生活习惯。
少精症可以做试管婴儿吗？
泰国皇家生殖遗传医院试管专家指出，少精症患者是可以进行试管婴儿的治疗的，试管婴儿的成功率与精子本身的质量有很大的关系。精子的质量越好，试管婴儿的成功率在一定程度上也会比较高，所以轻度少精症患者的试管婴儿成功率肯定是比较大的。男性若有少精症的情况，可以选择第二代试管婴儿技术进行助孕，又称卵母细胞胞浆内单精子显微注射技术。该技术的操作方法是将卵子从女性体内取出后，选择活力好、形态正常的单个精子用显微注射针将其直接注射到卵细胞内，继续培养确定卵细胞已受精并分裂后，将胚胎移植到子宫腔内使其继续生长发育成胎儿。该技术适用于男性因素造成的不孕，包括男方少精症、弱精症、畸精症。即使男方精液中只有极少量的存活的精子，只要能从睾丸及附睾中穿刺能够得到少量的成熟活精子，基本都有可能通过这种技术获得妊娠。
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